EC運用代行おすすめ10選をECの専門家が解説！

「ECを立ち上げたものの、日々の運用に追われて売上改善まで手が回らない」
「楽天・Amazon・自社ECを運営しているけれど、どのチャネルに力を入れるべきかわからない」
「商品登録や広告運用だけでなく、売上を伸ばすところまで任せられる会社を探している」

EC運用は、商品登録や受注処理をこなせば終わりではありません。
売上を伸ばすには、商品ページ、広告、SEO、セール設計、CRM、在庫、レビューなど、複数の要素を継続的に改善する必要があります。

特に重要なのは、「作業を代わりにやってくれる会社」ではなく、集客・CVR・LTVのどこに課題があるかを見極め、売上と利益につながる運用をしてくれる会社を選ぶことです。

本記事では、ECの専門家の視点から、EC運用代行会社の選び方・費用相場・おすすめ10社を解説します。

EC運用代行会社を選ぶ3つのポイント

EC運用代行は、会社によって対応モールも支援範囲も大きく異なります。まず「どこまで任せたいか」を整理したうえで、以下の3つを比較しましょう。

① 対応チャネルと任せられる業務範囲を確認する

楽天市場に強い会社、Amazonに強い会社、自社EC・Shopifyまで横断できる会社など、得意なチャネルは会社ごとに異なります。

商品登録・ページ制作・広告運用だけを任せたいのか、受注管理やCRMまで含めてEC事業部ごと任せたいのかで、選ぶ会社は変わります。

複数モールを運営している場合は、モールごとに別々の施策を打つのではなく、在庫・広告・販促予算を横断して考えられるかも確認しましょう。

② 自社商材の実績と「売上のどこを改善するか」を見る

ECの売上は「集客数×CVR×LTV」で考えると、どこがボトルネックなのか整理しやすくなります。

アクセス不足なら広告やSEO、アクセスはあるのに売れないなら商品ページや導線、初回購入後に伸びないならCRMやリピート施策が必要です。

コスメ、食品、アパレル、家電では勝ち方が違うため、自社と近いカテゴリでの支援実績があるかも確認しましょう。

③ 料金体系・契約期間・担当体制まで比較する

EC運用代行には、月額固定型、成果報酬型、固定費＋成果報酬型などがあります。

売上がすでに大きい店舗では、成果報酬率が低く見えても総額が高くなることがあります。

月額費用だけでなく、最低契約期間、広告費、制作費、追加作業の料金、月次レポートや定例会の有無まで確認することが大切です。

EC運用代行の費用相場

EC運用代行の料金は、任せる業務と店舗規模によって大きく変わります。広告費や制作費が別料金の会社も多いため、「月額いくらか」だけでなく、何が料金に含まれているかを見ることが重要です。

部分代行・限定支援：月額5万円〜20万円程度

広告運用、商品登録、SEO、ページ改善など、特定の業務だけを依頼するケースです。

社内にEC担当者はいるものの、専門性が必要な業務だけ外部へ任せたい企業に向いています。

作業量や対象モールが増えると追加料金になるため、月間の対応件数も確認しましょう。

運営代行・コンサル一体型：月額15万円〜50万円程度

販売計画、セール対応、広告、商品ページ改善、分析まで、売上改善を含めて継続的に任せる場合の中心的な価格帯です。

楽天スーパーSALEやAmazonの大型セールなど、イベント対応をどこまで含むかでも費用は変わります。

定例会やレポーティングを通じて、数字を見ながら改善していく会社が向いています。

フル運営・複数チャネル支援：月額50万円〜100万円以上

複数モールや自社ECを横断し、制作、広告、CRM、受注・在庫、カスタマー対応まで幅広く任せるケースです。

EC事業部に近い役割を外部へ委託するため、支援チームの人数や業務範囲によって金額は大きくなります。

売上規模が大きい企業ほど、運用費の安さよりも「粗利・在庫・LTVまで見て利益を残せるか」で比較することが大切です。

EC運用代行おすすめ10選

ではここから、EC運用代行に強いおすすめ10社を、それぞれの特徴・実績・料金とあわせてご紹介します。

EC運用代行おすすめ① 株式会社Venture Ocean

おすすめポイント

• 楽天・Amazon・Qoo10・自社ECを横断した支援
• 商品開発からEC運用・広告・SNSまで一気通貫
• D2C・コスメ・食品・日用品の売上改善に強み

株式会社Venture Oceanの概要・実績・料金

URL	https://venture-ocean.com/
所在地	大阪府堺市西区浜寺南町
設立年	2023年
実績詳細	・ヘアケアブランドのECモール立ち上げで売上10億円 ・冷凍食品のAmazon運用代行で売上300％伸長 ・美容サプリの楽天運用で月商10倍
料金	月額30万円〜

◎こんな方におすすめ

• EC運用だけでなく事業戦略から相談したい方
• 複数モールを横断して売上を伸ばしたい方
• D2Cブランドの成長を伴走してほしい方

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EC運用代行おすすめ② 株式会社Proteinum

おすすめポイント

• 楽天・Amazon・ShopifyなどECプラットフォーム経験者が在籍
• 戦略からページ制作・広告・運営までワンストップ
• データ分析と高速PDCAを重視

株式会社Proteinumの概要・実績・料金

URL	https://proteinum.co.jp/
所在地	東京都港区新橋
設立年	2020年
実績詳細	・支援開始3か月で月商50万円から1,500万円規模へ成長した事例 ・Amazon・Shopify・makeshopなど主要ECサービスとの連携実績
料金	要問い合わせ

◎こんな方におすすめ

• データをもとに運用を改善したい方
• EC戦略から実行までまとめて任せたい方
• 楽天・Amazonの専門知識を重視する方

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EC運用代行おすすめ③ アートトレーディング株式会社

おすすめポイント

• 20年以上のEC支援ノウハウ
• EC制作・運営・コンサル・物流まで対応
• 売上だけでなく運営体制の構築も支援

アートトレーディング株式会社の概要・実績・料金

URL	https://art-trading.co.jp/
所在地	東京都豊島区東池袋
設立年	1996年
実績詳細	・200社以上のECサイト構築・運営支援 ・平均3か月で売上1.5倍の実績を公開 ・フルフィルメントまで一貫対応
料金	月額20万円〜

◎こんな方におすすめ

• EC運営と物流をまとめて相談したい方
• 自社のEC運営体制も整えたい方
• 中長期で伴走してくれる会社を探す方

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EC運用代行おすすめ④ 株式会社idiom

おすすめポイント

• 成果報酬型のEC運営代行に対応
• ショップ立ち上げからバックオフィスまで委託可能
• Shopifyを活用した越境ECにも対応

株式会社idiomの概要・実績・料金

URL	https://idiom-inc.co.jp/
所在地	東京都板橋区大山金井町
設立年	2015年
実績詳細	・ショップ立ち上げから2年で月商5,000万円の事例 ・月商1,000万円規模から1年で月商1億円台へ成長した事例
料金	成果報酬5％〜

◎こんな方におすすめ

• 固定費を抑えて運用代行を始めたい方
• 受注・配送までまとめて任せたい方
• 越境ECも視野に入れている方

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EC運用代行おすすめ⑤ 株式会社ワンプルーフ

おすすめポイント

• EC事業部の業務委託に近い総合支援
• 運営代行・コンサル・フルフィルメントまで対応
• 大手企業を含む2,000社以上の支援実績

株式会社ワンプルーフの概要・実績・料金

URL	https://www.one-proof.co.jp/
所在地	東京都新宿区西新宿
設立年	2008年
実績詳細	・ECモール運営、自社EC運営、カスタマーサポートに対応 ・国内外の大手企業を含む2,000社以上を支援
料金	要問い合わせ

◎こんな方におすすめ

• EC事業部単位で業務を任せたい方
• 組織的な運用体制を求める方
• 受注やCSまで含めて外注したい方

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EC運用代行おすすめ⑥ 株式会社YUGETA ECコンサルティング

おすすめポイント

• 楽天市場を中心に豊富なECコンサル経験
• コンサルから運営代行まで専任担当者が対応
• 予算に合わせて支援内容を設計できる

株式会社YUGETA ECコンサルティングの概要・実績・料金

URL	https://www.ecconsulting.tokyo/
所在地	東京都新宿区西新宿
設立年	2016年
実績詳細	・月商350万円の店舗を2年で月商3.5億円へ成長 ・コンサルタント約20名で累計約3,000社のECコンサル経験
料金	予算に応じて自由設定

◎こんな方におすすめ

• 楽天市場の売上を伸ばしたい方
• 予算に合わせて支援内容を調整したい方
• 専任担当者に深く入ってほしい方

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EC運用代行おすすめ⑦ ジャグー株式会社

おすすめポイント

• 楽天・Amazon・Yahoo!・Qoo10・TikTok Shopまで対応
• 売上だけでなく利益を重視した運用
• 各モール専属のコンサルタント体制

ジャグー株式会社の概要・実績・料金

URL	https://jagoo.co.jp/
所在地	東京都中央区築地
設立年	2020年
実績詳細	・楽天市場の運営代行で平均月商132％増 ・年間20億円規模のモール広告運用実績 ・楽天SOY受賞店舗の支援実績
料金	店舗運営代行 月額50万円〜

◎こんな方におすすめ

• 楽天・Amazonの運営を本格的に任せたい方
• 利益まで管理してほしい方
• 複数モールを横断して伸ばしたい方

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EC運用代行おすすめ⑧ 株式会社ピュアフラット

おすすめポイント

• 楽天・Amazon・Qoo10・Yahoo!ショッピングに対応
• 広告運用を自社内で完結
• 専任担当者による伴走型の運用

株式会社ピュアフラットの概要・実績・料金

URL	https://pureflat.co.jp/
所在地	東京都港区南青山
設立年	2020年
実績詳細	・3,000店舗以上の支援実績 ・契約後の売上アップ率平均372％を公開 ・Qoo10で1か月で売上2〜3倍の事例
料金	月額10万円〜

◎こんな方におすすめ

• ECモールの売上を短期間で改善したい方
• 広告効率も同時に改善したい方
• 主要モールをまとめて相談したい方

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EC運用代行おすすめ⑨ NE株式会社

おすすめポイント

• 楽天・Amazon・Yahoo!・自社ECに対応
• ECコンサル・運営代行・広告運用まで支援
• ECバックヤードのSaaS運営で培った現場知見

NE株式会社の概要・実績・料金

URL	https://consulting.ne-inc.jp/
所在地	神奈川県横浜市港北区新横浜
設立年	2022年
実績詳細	・約1,000サイトのEC支援実績 ・EC支援企業BEST100 ECコンサル部門受賞 ・ネクストエンジンを含むEC支援基盤を展開
料金	月額7.5万円〜

◎こんな方におすすめ

• 比較的抑えた費用から相談したい方
• 運営とバックヤードを効率化したい方
• 複数モールを運営している方

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EC運用代行おすすめ⑩ 株式会社いつも

おすすめポイント

• EC・D2C領域の総合支援に強み
• サイト構築・広告・運営・物流・越境ECまで対応
• 大規模ブランドやメーカーのEC支援にも対応

株式会社いつもの概要・実績・料金

URL	https://itsumo365.co.jp/
所在地	東京都千代田区有楽町
設立年	2007年
実績詳細	・EC支援の契約案件数は延べ14,000件以上 ・自社EC、楽天、Amazon、越境ECなど幅広いチャネルを支援
料金	月額40万円〜

◎こんな方におすすめ

• 大規模なEC運営を任せたい企業
• 物流や越境ECまで一括で相談したい方
• 総合力のある支援会社を求める方

EC運用代行に関するよくある質問

Q1. EC運用代行ではどこまで任せられますか？

会社によって異なりますが、商品登録、ページ制作、広告運用、SEO、セール対応、メルマガ・LINE、受注処理、在庫管理、カスタマー対応まで委託できる会社があります。
自社で残したい業務と外注したい業務を先に整理すると、会社を比較しやすくなります。

Q2. EC運用代行の費用はいくらですか？

一部業務なら月額5万円〜20万円程度、戦略と運営を含む場合は月額15万円〜50万円程度、EC事業部に近いフル運営では月額50万円〜100万円以上になることがあります。
成果報酬型では売上に応じて料金が増えるため、現在の月商をもとに総額を試算しましょう。

Q3. ECコンサルとEC運用代行の違いは何ですか？

ECコンサルは分析や戦略提案が中心で、運用代行は商品登録、広告入稿、ページ更新、セール対応などの実務まで担当します。
社内に実行できる人がいない場合は、提案だけでなく実務まで対応できる運用代行会社が向いています。

EC運用代行おすすめ10選のまとめ

EC運用代行会社は、単純な作業代行に強い会社、楽天やAmazonなど特定モールに強い会社、EC事業全体を任せられる会社など、それぞれ得意分野が異なります。
知名度や料金だけで選ぶのではなく、自社の課題と任せたい業務に合っているかを見ることが大切です。

まずは「人手が足りない」のか、「アクセスが足りない」のか、「アクセスはあるのに売れない」のか、「リピートしない」のかを整理してみましょう。
同じ「売上が伸びない」という悩みでも、必要な運用はまったく変わります。

また、楽天・Amazon・Qoo10・自社ECを複数運営している場合は、一つのモールだけを最適化しても全体売上が伸びないことがあります。
広告、在庫、CRM、SNSまで含めて、チャネル横断で考えられる会社を選ぶと運用がぶれにくくなります。

EC運用代行を「作業を減らすための外注」だけで終わらせず、売上と利益を伸ばすためのパートナーとして選ぶことが成功のポイントです。

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